Mereka yang Tak Terlihat mengisahkan Lidya, seorang single parent dari dua putri bernama Saras dan Laras. Demi memenuhi kebutuhan keluarga, ia bekerja sebagai pengusaha kue kering.
Di sisi lain, sang anak sulung Saras merupakan seorang indigo. Ia dapat melihat makhluk-makhluk tak kasat mata sejak ia kecil.
Namun, Lidya tidak percaya atas kemampuan Saras. Ia menganggapnya tak masuk akal dan ini membuat hubungannya dengan sang putri menjadi renggang.
Masala mulai muncul saat Saras berusia 17 tahun. Ia kesurupan hingga Lidya khawatir dan meminta pertolongan pada kakaknya, Tante Rima, yang seorang psikolog.
Sayangnya, Tante Rima menolak karena merasa Lidya yang harus mengatasi masalah itu selaku ibu dari Saras.
Hubungan antara Saras dan Lidya semakin memanas saat Saras didatangi oleh arwah bernama Dinda, seorang siswa SMA yang meninggal dunia karena ditindas dan meminta pertolongan untuk dipertemukan dengan sang ibu.
Apa yang akan Saras lakukan selanjutnya? Akankah ia membantu Dinda? Bagaimana hubungannya dengan sang ibu?